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【池化方法】多示例学习池化(MIL pooling)公式与代码

【池化方法】多示例学习池化(MIL pooling)公式与代码

  一般的池化方法包括最大池化、平均池化、自适应池化与随机池化,这几天意外看到了多示例学习池化,感觉挺有意思的,记录一下。
  论文
  代码

1. 多示例学习(Multiple instance learning,MIL)

  经典深度学习的数据是一张图一个类别,而多示例学习的数据是一个数据包(bag),一个bag标记一个类别,bag中的每一张图称为一个示例(instance)。形象一点的例子就是,一位患者扫了一次CT,产生了很多张CT切片图像,此时,一张CT切片为一个instance,所有CT切片为一个bag。如果所有的CT切片都检测为没病,那么这位患者正常,否则,这名患者患病。
  其基本模式如下图所示:
【池化方法】多示例学习池化(MIL pooling)公式与代码

2. MIL pooling

  最大池化和平均池化都是不可训练的,设计灵活且自适应的MIL池化可以通过针对任务和数据进行调整,以实现更好的结果。

2.1 注意机制(Attention mechanism)

  该方法使用每一个instance低维嵌入的加权平均值,其权重系数通过神经网络学习得到,权重系数之和为1。设 H = { h 1 , … , h K } H = \\left\\{ {{h_1}, \\ldots ,{h_K}} \\right\\} H={h1,,hK}为一个bag中的K个嵌入,则:
z = ∑ k = 1 K a k h k {z = \\sum\\limits_{k = 1}^K {{a_k}{h_k}}} z=k=1Kakhk a k = exp ⁡ { w ⊤ tanh ⁡ ( V h k ⊤ ) } ∑ j = 1 K exp ⁡ { w ⊤ tanh ⁡ ( V h j ⊤ ) } {{a_k} = \\frac{{\\exp \\left\\{ {{w^ \\top }\\tanh (Vh_k^ \\top )} \\right\\}}}{{\\sum\\limits_{j = 1}^K {\\exp \\left\\{ {{w^ \\top }\\tanh (Vh_j^ \\top )} \\right\\}} }}} ak=j=1Kexp{wtanh(Vhj)}exp{wtanh(Vhk)}  其中 w ∈ R L × 1 {w \\in R{^{L \\times 1}}} wRL×1, V ∈ R L × M {V \\in R{^{L \\times M}}} VRL×M为参数,可由全连接层实现。 L {L} L为低维嵌入大小, M {M} M为中间维度。

2.2 门控注意机制(Gated attention mechanism)

  由于 tanh ⁡ ( x ) {\\tanh (x)} tanh(x) x ∈ [ − 1 , 1 ] {x \\in [ - 1,1]} x[1,1]时近似线性,这可能会限制instance之间学习关系的最终表达。作者设计了一种门控机制,即:
a k = exp ⁡ { w ⊤ ( tanh ⁡ ( V h k ⊤ ) ⊙ s i g m o i d ( U h k ⊤ ) ) } ∑ j = 1 K exp ⁡ { w ⊤ ( tanh ⁡ ( V h j ⊤ ) ⊙ s i g m o i d ( U h j ⊤ ) ) } {{a_k} = \\frac{{\\exp \\left\\{ {{w^ \\top }(\\tanh (Vh_k^ \\top ) \\odot sigmoid(Uh_k^ \\top ))} \\right\\}}}{{\\sum\\limits_{j = 1}^K {\\exp \\left\\{ {{w^ \\top }(\\tanh (Vh_j^ \\top ) \\odot sigmoid(Uh_j^ \\top ))} \\right\\}} }}} ak=j=1Kexp{w(tanh(Vhj)sigmoid(Uhj))}exp{w(tanh(Vhk)sigmoid(Uhk))}  其中, U ∈ R L × M {U \\in R{^{L \\times M}}} URL×M为参数, ⊙ { \\odot } 为元素级相乘,门控机制引入了可学习的非线性,潜在地消除了 tanh ⁡ ( x ) {\\tanh (x)} tanh(x)中麻烦的线性。

3. MIL pooling的PyTorch代码

import torch
import torch.nn as nn
import torch.nn.functional as Fclass Attention(nn.Module):def __init__(self):super(Attention, self).__init__()self.L = 500self.D = 128self.K = 1self.feature_extractor_part1 = nn.Sequential(nn.Conv2d(1, 20, kernel_size=5),nn.ReLU(),nn.MaxPool2d(2, stride=2),nn.Conv2d(20, 50, kernel_size=5),nn.ReLU(),nn.MaxPool2d(2, stride=2))self.feature_extractor_part2 = nn.Sequential(nn.Linear(50 * 4 * 4, self.L),nn.ReLU(),)# w 和 V 由两个线性层实现self.attention = nn.Sequential(nn.Linear(self.L, self.D),nn.Tanh(),nn.Linear(self.D, self.K))self.classifier = nn.Sequential(nn.Linear(self.L*self.K, 1),nn.Sigmoid())def forward(self, x):# 设输入张量大小为[20, 1, 30, 30],即有20个instancex = x.squeeze(0)   # [20, 1, 30, 30]H = self.feature_extractor_part1(x)  # [20, 50, 4, 4] 特征提取下采样H = H.view(-1, 50 * 4 * 4)   # [20, 800] 通道合并H = self.feature_extractor_part2(H)  # NxL  [20, 500] 低维嵌入A = self.attention(H)  # NxK  [20, 1] 计算akA = torch.transpose(A, 1, 0)  # KxN  [1, 20] 每个instance一个权重A = F.softmax(A, dim=1)  # softmax over N  [1, 20] softmax使权重之和为1M = torch.mm(A, H)  # KxL  [1, 500] 计算ak乘以hkY_prob = self.classifier(M)  # [1, 1] 分类器输出概率Y_hat = torch.ge(Y_prob, 0.5).float()  # [1, 1] 大于0.5为1return Y_prob, Y_hat, Aclass GatedAttention(nn.Module):def __init__(self):super(GatedAttention, self).__init__()self.L = 500self.D = 128self.K = 1self.feature_extractor_part1 = nn.Sequential(nn.Conv2d(1, 20, kernel_size=5),nn.ReLU(),nn.MaxPool2d(2, stride=2),nn.Conv2d(20, 50, kernel_size=5),nn.ReLU(),nn.MaxPool2d(2, stride=2))self.feature_extractor_part2 = nn.Sequential(nn.Linear(50 * 4 * 4, self.L),nn.ReLU(),)self.attention_V = nn.Sequential(nn.Linear(self.L, self.D),nn.Tanh())self.attention_U = nn.Sequential(nn.Linear(self.L, self.D),nn.Sigmoid())self.attention_weights = nn.Linear(self.D, self.K)   # wself.classifier = nn.Sequential(nn.Linear(self.L*self.K, 1),nn.Sigmoid())def forward(self, x):x = x.squeeze(0)H = self.feature_extractor_part1(x)H = H.view(-1, 50 * 4 * 4)H = self.feature_extractor_part2(H)  # NxLA_V = self.attention_V(H)  # NxD tanhA_U = self.attention_U(H)  # NxD SigmoidA = self.attention_weights(A_V * A_U) # element wise multiplication # NxKA = torch.transpose(A, 1, 0)  # KxNA = F.softmax(A, dim=1)  # softmax over NM = torch.mm(A, H)  # KxLY_prob = self.classifier(M)Y_hat = torch.ge(Y_prob, 0.5).float()return Y_prob, Y_hat, A

   MIL pooling也不一定限制在多示例学习中使用,如对三维数据采用不同的二维降采样方法,得到的数据经特征提取后进行融合,也可以采用这种池化方法。